Исследователи Санкт-Петербургского государственного университета разработали уникальную программу для анализа результатов геномов микроорганизмов в биологических образцах. Эта разработка, известная как Antimicro, учитывает особенности российского микробиома, что делает ее единственной в своем роде.
«Жители каждой страны имеют уникальный состав бактерий и их численность. До недавнего времени анализ микрофлоры россиян проводился на основе данных из других стран, так как информация о нашем микробиоме была ограничена. Мы решили эту проблему», – поделился младший научный сотрудник кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ Лаврентий Данилов.
Анализ бактериальной флоры часто назначается при инфекциях для точного определения патогена и назначения целенаправленной терапии. Однако стандартные методы, такие как бакпосев или ПЦР, не всегда позволяют установить возбудителя. В таких случаях врачи прибегают к метагеномному секвенированию, которое анализирует микробное сообщество в биологических материалах на основе ДНК.
Программа Antimicro обрабатывает загруженные данные и формирует заключение, включающее информацию о количестве и видах бактерий в образце, а также об их устойчивости к антибиотикам. Программа полностью на русском языке и снабжена подробной инструкцией, что делает ее доступной даже для неопытных пользователей. Кроме основного модуля для анализа метагенома, разработчики добавили справочник микроорганизмов и лекарственных средств, а также раздел для подбора терапии.
В университете отметили, что ученые СПбГУ стремятся получить сертификат соответствия от Министерства здравоохранения РФ, что позволит использовать программу не только на платной основе, но и в рамках обязательного медицинского страхования. На данный момент ни одна аналогичная программа не имеет такого сертификата.
Antimicro найдет применение в различных областях медицины, таких как инфекционные болезни, фармакологии, экологии, биотехнологии, сельском хозяйстве и пищевой промышленности. Программа поможет врачам спасать больше жизней и снижать риск тяжелых хронических заболеваний, связанных с изменениями в микробиоме.
Источник: ТАСС
распечатать статью
